公司在以下情况下可以选择零申报：

增值税零申报：小规模纳税人应税收入为零，或者一般纳税人当期既没有销项税额，也没有进项税额时，可以申请增值税零申报。

企业所得税零申报：纳税人当期没有经营，收入成本都为零的情况下可以申请企业所得税零申报。

其他税种零申报：计税依据为零时，可以申请零申报。

此外，以下几种情况也可以进行零申报：

刚刚注册的企业：新注册的企业在开始经营活动之前，需要向税务机关进行零申报。

暂停经营的企业：如果企业因为某种原因暂时停止了经营活动，那么在这段时间内，企业可以进行零申报。

企业处于清算阶段：如果企业处于清算阶段，那么在清算期间，企业可以进行零申报。

需要注意的是，零申报并不等于不申报。即使企业没有发生应税行为，也需要按照规定的时间向税务机关提交税务申报表，否则可能会被视为逃税，受到相应的处罚。