1、不按规定时限纳税申报，情节较轻的，除补缴税款外，税务机关将对企业会罚款，如果超期更长的，将还会加收滞纳金；对于情节严重的，税务机关将更具情节严重程度，出于相应的更高金额的罚款。

2、连续3个月不到税务登记机关纳税申报的，税务登记机关将对该企业的税务登记证给于注销的处理。当税务登记证被税务局注销之后将不可能再被恢复，也就是说，企业的所有证照都会因为税务登记证的注销而相继作废。

3、公司所有股东的身份证信息将被相关登记机关收录，进入黑名单。对以后的贷款、再次投资创业、出国等都将受到影响。